瘤发生过程中被异常招募、修饰或固定表达。
该模件的核心功能或许不是致癌本身,而是提供一种身份认证接口。正常生理状态下,它可能参与有限的、受严格调控的细胞间识别,如特定干细胞龛、组织边界维持。癌细胞劫持了这一接口,将其变为维持自身生存社群或逃避免疫监视的身份锁。
如果此类“身份锁”是一个族系,那么理论上,应该存在对应的“钥匙”族系K因子系列,以前在骨肉瘤上发现的K因子及与之对应的靶点是一个完美的钥匙——锁的组合。
如果假定这些身份锁是一个家族系列,那么K因子也应该有家族系列,如果能够解开这些系列内在规律,我们可以逆向设计的K因子来打开锁。
不同的肿瘤类型,甚至同一肿瘤的不同亚型,可能选用了该族系中不同的结构变体为锁具。而现在研究的关键在于绘制完整的“锁具”族谱;找到或设计能打开特定锁的“钥匙”。
写完这些,杨平靠在椅背上,闭上眼睛。脑海中的图像却更加清晰:不是一个靶点,不是一个疗法,而是一个完整的、隐藏的识别系统,一套被癌细胞隐藏的身份语言,一个完整没有被发现的理论。
这不再是发现一个新靶点那么简单,这是在试图破译癌症的某个全新的机制。
宋子墨、唐顺和陆小路敲了很久的门,杨平没有反应,等杨平从思考中回过神来,想起隐隐约约的敲门声,他打开办公室的门。
大家见到安然无恙的杨平才松一口气,他们知道教授经常会闭目养神沉浸在思考中,但是有时候还是不免会有些担心。
“我需要所有能找到的、不同类型的实体瘤的表面抗原复合物高分辨率结构数据,尤其是那些具有肿瘤类型特异性的。”杨平直接蹦出一句。
宋子墨愣了一下:“教授,您是说所有类型?这数据量和对齐分析的工作量……”
“我知道,非常巨大。”杨平打断他,他将自己的A4纸草稿推到宋子墨面前,“但我怀疑我们撞到了什么东西的边界,不是一个点,而是一个面,甚至一个体系。”
办公室安静下来,唐顺盯着那A4纸,呼吸逐渐加快,他比任何人都清楚,这种拓扑结构的相似性如果成立且具有普遍性,意味着什么。
而且,三人都明白,每次教授出手A4纸草稿的时候意味着什么。
“这……这像是发现了蛋白质结构世界里的一个‘暗物质家族’。”陆小路喃喃道,“表面序列千差万别,但核心折叠和功能口袋被保留了下来,如果不是放在一起、用这种方式看,绝对发现不了。”
“所以我们需要更多证据。”杨平转向宋子墨,“联系全世界所有能联系的医院与研究机构,特别是那些拥有独特肿瘤细胞系或类器官库的,请求他们提供表面蛋白组学数据和尽可能多的结构信息。”
“我马上联系安德森的凯瑟琳博士那边?”格里芬说。
“她的PAC-FUS1样本非常重要,我们需要更多,我们还需要其他更多的样本,我刚说的所有的样本,越多越好,一个安德森远远不够,我们需要更多的支持者。”杨平的语气平淡却不容置疑。
格里芬医生立即问道:“教授,从临床角度看,如果这个‘族系’假说成立,会改变什么?”
杨平转过身,在白板上画了一个大树状的图:“想象这是一棵肿瘤身份锁的进化树,树根可能是那个古老的细胞识别模件。不
该模件的核心功能或许不是致癌本身,而是提供一种身份认证接口。正常生理状态下,它可能参与有限的、受严格调控的细胞间识别,如特定干细胞龛、组织边界维持。癌细胞劫持了这一接口,将其变为维持自身生存社群或逃避免疫监视的身份锁。
如果此类“身份锁”是一个族系,那么理论上,应该存在对应的“钥匙”族系K因子系列,以前在骨肉瘤上发现的K因子及与之对应的靶点是一个完美的钥匙——锁的组合。
如果假定这些身份锁是一个家族系列,那么K因子也应该有家族系列,如果能够解开这些系列内在规律,我们可以逆向设计的K因子来打开锁。
不同的肿瘤类型,甚至同一肿瘤的不同亚型,可能选用了该族系中不同的结构变体为锁具。而现在研究的关键在于绘制完整的“锁具”族谱;找到或设计能打开特定锁的“钥匙”。
写完这些,杨平靠在椅背上,闭上眼睛。脑海中的图像却更加清晰:不是一个靶点,不是一个疗法,而是一个完整的、隐藏的识别系统,一套被癌细胞隐藏的身份语言,一个完整没有被发现的理论。
这不再是发现一个新靶点那么简单,这是在试图破译癌症的某个全新的机制。
宋子墨、唐顺和陆小路敲了很久的门,杨平没有反应,等杨平从思考中回过神来,想起隐隐约约的敲门声,他打开办公室的门。
大家见到安然无恙的杨平才松一口气,他们知道教授经常会闭目养神沉浸在思考中,但是有时候还是不免会有些担心。
“我需要所有能找到的、不同类型的实体瘤的表面抗原复合物高分辨率结构数据,尤其是那些具有肿瘤类型特异性的。”杨平直接蹦出一句。
宋子墨愣了一下:“教授,您是说所有类型?这数据量和对齐分析的工作量……”
“我知道,非常巨大。”杨平打断他,他将自己的A4纸草稿推到宋子墨面前,“但我怀疑我们撞到了什么东西的边界,不是一个点,而是一个面,甚至一个体系。”
办公室安静下来,唐顺盯着那A4纸,呼吸逐渐加快,他比任何人都清楚,这种拓扑结构的相似性如果成立且具有普遍性,意味着什么。
而且,三人都明白,每次教授出手A4纸草稿的时候意味着什么。
“这……这像是发现了蛋白质结构世界里的一个‘暗物质家族’。”陆小路喃喃道,“表面序列千差万别,但核心折叠和功能口袋被保留了下来,如果不是放在一起、用这种方式看,绝对发现不了。”
“所以我们需要更多证据。”杨平转向宋子墨,“联系全世界所有能联系的医院与研究机构,特别是那些拥有独特肿瘤细胞系或类器官库的,请求他们提供表面蛋白组学数据和尽可能多的结构信息。”
“我马上联系安德森的凯瑟琳博士那边?”格里芬说。
“她的PAC-FUS1样本非常重要,我们需要更多,我们还需要其他更多的样本,我刚说的所有的样本,越多越好,一个安德森远远不够,我们需要更多的支持者。”杨平的语气平淡却不容置疑。
格里芬医生立即问道:“教授,从临床角度看,如果这个‘族系’假说成立,会改变什么?”
杨平转过身,在白板上画了一个大树状的图:“想象这是一棵肿瘤身份锁的进化树,树根可能是那个古老的细胞识别模件。不
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